塩基配列からアミノ酸配列への変換

結果の見方と目安
項目 意味 目安
フレーム 翻訳に使った読み枠です。+1、+2、+3は入力配列、逆相補1、逆相補2、逆相補3は逆相補鎖を翻訳します。 CDS配列なら通常は+1です。向きや読み枠が不明な配列では全6フレームを確認します。
翻訳範囲 そのフレームで実際に翻訳した塩基位置です。逆相補の場合は、逆相補鎖上での位置を示します。 CDS全体を翻訳したい場合は、範囲が目的配列全体に近いか確認します。
AA長 終止記号を除いたアミノ酸数です。Xは1残基として数えます。 予想タンパク質長と一致するか確認します。
終止数 翻訳結果に含まれる終止コドンの数です。終止コドンは*で表示します。 CDSの途中に*が出る場合は、読み枠違い、イントロン混入、配列エラー、偽遺伝子化などを疑います。
X数 曖昧塩基を含み、アミノ酸を一意に決められなかったコドン数です。 Xが多い場合は、Nなどの曖昧塩基を確認してください。
余り塩基 3塩基単位で翻訳できず、末端に残った塩基数です。 CDS配列では通常0です。1または2なら、配列の始点または終点がずれている可能性があります。
遺伝暗号 コドンをアミノ酸へ変換する対応表です。 核遺伝子では標準遺伝暗号を使います。ミトコンドリア配列や細菌配列では、対象に合う表を選んでください。